在上一期文章中，我们介绍了如何在线高效完成蛋白序列比对，并获得了.fasta或.fa格式的比对结果文件。本期，我们将通过ESPript工具，将这些比对结果转换成清晰、美观的图，让研究成果轻松达到出版级别。什么是ESPript？ESPript(EasySequencinginPostScript)是一个专为学术研究者设计的在线工具，可...

当我们研究一个蛋白时，探索其在不同物种间的保守性很关键。这不仅能帮助我们理解蛋白的功能和进化历史，还能为进一步实验设计提供线索，如保守性等。在本期文章中，我们将教你如何通过Uniprot网站，快速完成多物种蛋白序列比对和进化树构建。无需下载任何工具，全程在线完成，简单高效！✨步骤一：打开Uniprot并检索目标蛋白打开uniprot网站：https://...

在上一期教程中，我们在VMware虚拟机中成功安装了Ubuntu系统。然而，许多朋友可能会发现，新安装的Ubuntu系统在使用过程中存在一些小问题，比如屏幕边缘有黑边、无法自动调整分辨率，以及虚拟机与主机之间无法实现剪切板内容的同步等。这些问题虽然不影响系统的正常运行，但会对用户体验造成一定的不便。在使用VMware时，你可能还会看到VM...

上期我们一起下载并安装了VMware，您的电脑里已经有了虚拟机，现在我们一起来为虚拟机配置Linux环境。这里我们选择使用Ubuntu桌面版系统。ubuntu系统是一个以桌面应用为主的Linux操作系统，Ubuntu基于Debian发行版和GNOME桌面环境。Ubuntu的目标在于为一般用户提供一个最新的、同时又相当稳定的主要由自由软件构建而成的操作系统，它可免费使用，并带有社团及专业的支持应。接…

上期我们介绍了TissueEnrich包的安装方法以及对人鼠的基因列表进行组织特异性基因富集分析，本期我们来学习TissueEnrich包如何鉴定组织特异性基因，本期主要用到TissueEnrich的teGeneRetrieval功能函数，该函数可探索任意物种的组织特异性表达基因。teGeneRetrieval函数：组织特异性表达基因识别在基...

VMwareWorkstation介绍VMwareWorkstation在生物信息学中常用于模拟操作系统环境，例如在Windows上运行Linux系统以支持特定的软件工具（如GATK、Blast、STAR等）。它可以用于测试生物信息软件的兼容性，配置高性能虚拟机运行计算密集型任务（如RNA-seq分析），以及通过隔离环境确保数据安全。...

科研数据分析中，如何知道你的差异基因或得到的基因列表富集在什么组织中？今天分享的TissueEnrich包可以轻松帮你解答这个问题。我们一起来学习一下这个R包。TissueEnrich包简介TissueEnrich包用于计算一组输入基因中的组织特异性基因富集程度。例如，用户可以输入RNA-Seq数据中表达量最高的基因或基因共表达模块，以确定在这些数据集中...

上一期我们介绍了R语言数据读取的方法，这期我们一起全面了解下R语言的数据与图像输出的方法。在数据分析和可视化过程中，输出数据和图像至关重要。R语言提供了丰富的函数和包，用于导出数据文件和生成多种格式的图像文件。本期我们一起了解常见的数据和图像输出方法。R语言中的数据与图像输出方法一、数据输出方法Rstudio输出数据Rstudio输出数据非常简单，在Environment窗口中点击保存的图像，再输…

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